11월 말에 직원이 한 명 나가면, 대표님 머릿속에는 12월에 해야 할 연말정산이 먼저 떠오릅니다. 어차피 한 달 뒤에 전 직원 정산을 하니 퇴사자도 같이 처리하면 된다는 생각이죠. 급여 담당자가 따로 없는 소규모 사업장일수록 이렇게 정리하는 경우가 많습니다.
답부터 말씀드리면, 11월 퇴사자의 연말정산은 퇴사월 급여를 지급할 때 하는 중도정산이 원칙이고, 재직자와 함께 하는 정산은 처음부터 선택지가 아닙니다. 다만 퇴사월 급여를 12월에 지급하는 회사라면 12월에 정산하는 것이 곧 법정 시기이니, 결국 판단 기준은 급여 지급일입니다.
11월 퇴사자의 정산 시기는 "12월이냐 11월이냐"가 아니라 "퇴사월 급여를 언제 지급하느냐"로 정해집니다. 11월에 급여를 지급했다면 그날, 12월에 지급한다면 12월 지급일이 정산일입니다.
퇴사자는 재직자와 정산 시점이 다릅니다
재직자의 연말정산은 12월 31일 현재 근무하는 근로자를 대상으로 다음 해 2월분 급여를 지급할 때 합니다. 11월에 퇴사한 직원은 12월 31일에 회사에 없으므로 이 절차에 들어오지 않습니다. 소득세법은 해당 과세기간 중에 퇴직한 사람에 대해 퇴직하는 달의 근로소득을 지급할 때 퇴직일까지의 근로소득을 기준으로 정산하도록 정하고 있습니다.
왜 퇴사월에 정산하게 했을까
퇴사자는 다음 해 2월에 급여를 줄 일이 없습니다. 환급이든 추가징수든 정산을 이어갈 접점이 퇴사월 급여뿐이기 때문에, 법은 마지막 급여 지급 시점에 세액을 확정하도록 했습니다. 퇴사자가 다른 회사로 옮겨 가는 경우 새 회사가 이 결과를 받아 합산해야 하므로, 정산 결과를 담은 근로소득 원천징수영수증이 제때 나와야 하는 이유도 같습니다.
중도정산에서 반영되는 범위
퇴사자가 소득·세액공제 신고서와 증빙을 내면 부양가족 공제, 의료비, 교육비, 기부금 등이 반영됩니다. 내지 않으면 본인 기본공제 등 기본 사항만 반영해 정산합니다. 1월에 열리는 연말정산 간소화 서비스는 퇴사 시점에 쓸 수 없으니 증빙은 퇴사자가 직접 챙겨야 합니다. 서류를 안 낸 퇴사자는 다음 해 5월 종합소득세 신고에서 추가 공제를 받아 환급받는 길이 남아 있습니다.
급여 지급일에 따라 정산하는 달이 달라집니다
정산 시기를 정하는 것은 퇴사일이 아니라 퇴사월 급여를 지급하는 날입니다. 당월 말일에 급여를 주는 회사와 익월 10일에 주는 회사는 같은 11월 퇴사자라도 정산 달이 다릅니다.
| 구분 | 11월 퇴사자 (중도정산) | 12월 31일 재직자 (일반 연말정산) |
|---|---|---|
| 정산 시점 | 퇴사월 급여를 지급할 때 | 다음 해 2월분 급여를 지급할 때 |
| 정산 대상 기간 | 1월 1일부터 퇴사일까지 | 1월 1일부터 12월 31일까지 |
| 공제 자료 | 퇴사자가 직접 제출한 신고서·증빙 | 간소화 자료 + 근로자 제출 서류 |
| 정산 결과 서류 | 근로소득 원천징수영수증 발급 | 근로소득 원천징수영수증 발급 |
| 지급명세서 제출 | 다음 해 3월 10일까지 (퇴사자·재직자 모두 동일) | |
실제 상담에서 자주 보는 경우가 하나 있습니다. 직원 6명 규모의 음식점이 매월 말일에 급여를 주면서 11월 25일에 퇴사한 주방 직원의 11월분을 11월 30일에 지급하고, 정산은 "연말에 한꺼번에 하겠다"며 12월로 넘긴 사례입니다. 급여 지급일이 11월 30일이니 정산일도 11월 30일이고, 12월 정산은 이미 시기를 넘긴 처리가 됩니다.
12월로 미루면 생기는 일, 그리고 판단 기준
퇴사월 급여를 이미 지급했는데 정산을 뒤로 미루면 원천징수 납부가 늦어지고 퇴사자의 환급도 늦어집니다. 연쇄로 어떤 문제가 생기는지 보면 미룰 이유가 거의 없다는 점이 분명해집니다.
판단 기준은 세 가지입니다.
- 급여 지급일이 12월인가. 11월분을 12월 10일에 주는 회사는 12월에 정산해도 적법합니다. 재직자 정산이 아니라 퇴사자 중도정산을 12월 급여 업무에 포함시키는 것이니, 원천세 신고서에도 중도퇴사 정산 항목으로 따로 기재합니다.
- 퇴사자가 다른 회사로 옮기는가. 옮긴다면 새 회사가 다음 해 2월 정산에 합산할 영수증이 필요합니다. 이 경우는 지급일에 맞춰 바로 정산해야 퇴사자도, 새 회사도 일정이 꼬이지 않습니다.
- 정산 결과가 추가징수인가 환급인가. 환급이면 회사가 이미 낸 원천세에서 차감해 퇴사자에게 돌려주고 다음 달 10일 신고에서 조정합니다. 추가징수인데 마지막 급여가 징수할 세액보다 적으면 부족분은 다음 달 급여에서 징수하는 것이 원칙이지만, 다음 달 급여가 없는 퇴사자의 부족분 처리는 사전에 전문가 확인이 필요합니다.
11월 중순에 퇴사하고 마지막 급여를 11월 30일에 지급한 직원을 12월에 재직자와 함께 정산하면, 정산 자체는 기한을 넘기고 원천징수 납부도 하루 단위로 지연이 쌓입니다. 급여 지급일이 정산일이라는 점을 퇴사 처리 체크리스트에 넣어 두는 편이 안전합니다.
실제 금액으로 보는 중도정산 계산과 준비 순서
중도정산도 계산 구조는 일반 연말정산과 같습니다. 다음은 2026년 기준 세율로 단순화한 예시입니다. 월 급여 400만 원(비과세 없음), 1월부터 11월까지 근무, 본인 외 부양가족 없음, 4대보험 근로자 부담분 월 약 37만 원(11개월 약 413만 원), 매월 원천징수한 간이세액 15만 원(합계 165만 원)이라고 가정합니다. 실제 금액은 사업장과 개인별 공제에 따라 달라집니다.
| 단계 | 계산 | 금액 (가정) |
|---|---|---|
| 총급여 | 400만 원 × 11개월 | 4,400만 원 |
| 근로소득공제 | 750만 원 + (4,400만 원 − 1,500만 원) × 15% | 1,185만 원 |
| 과세표준 | 4,400만 − 1,185만 − 본인공제 150만 − 4대보험 약 413만 | 약 2,652만 원 |
| 산출세액 | 2,652만 원 × 15% − 누진공제 126만 원 | 약 271.8만 원 |
| 세액공제 | 근로소득세액공제(한도 66만 원) + 표준세액공제 13만 원 | 79만 원 |
| 결정세액 | 271.8만 원 − 79만 원 | 약 192.8만 원 |
| 정산 결과 | 결정세액 − 기납부 165만 원 | 약 27.8만 원 추가징수 (지방소득세 별도 약 2.8만 원) |
이 직원의 11월 급여가 400만 원이라면 추가징수액 약 30만 원은 급여에서 충분히 걷을 수 있습니다. 반대로 기납부 세액이 많았던 직원이라면 같은 구조에서 환급이 나옵니다. 어느 쪽이든 퇴사자는 퇴사 전에 신고서와 증빙을 내야 공제가 반영되므로, 회사가 먼저 서류를 안내하는 쪽이 정산 오류를 줄입니다.
올해 중간에 입사한 직원이 11월에 퇴사하는 경우, 종전 근무지의 근로소득 원천징수영수증이 없으면 앞선 회사의 급여가 빠진 채 정산됩니다. 합산이 누락되면 세액이 과소 계산되어 퇴사자가 다음 해 5월에 추가 납부하게 되므로, 입사 때 받은 서류가 있는지 퇴사 단계에서 한 번 더 확인해야 합니다.
11월 퇴사자의 정산일은 달력이 아니라 퇴사월 급여를 지급하는 날입니다.
급여 지급일, 재취업 여부, 추가징수 가능 여부를 퇴사 처리 단계에서 한 번에 확인하면 정산 시기와 서류 누락을 함께 잡을 수 있습니다. 업력 18년, 50인 전문가 팀이 있는 안택스 세무회계는 퇴사자 중도정산과 원천세 신고를 연말 일정에 맞춰 함께 점검하고 있습니다.